Mongoolia jõed pärinevad kõrgelt mägedest. Ja enamik neist on Siberi ja Kaug -Ida suurimate jõgede ülemjooks.
Zheltura jõgi
Jõesäng läbib Burjaatia (Venemaa) ja Mongoolia territooriumi. Zheltura on Dzhida jõe parempoolne lisajõgi. Jõe allikas on Mongoolia maadel. Jõekanali kogupikkus on 202 kilomeetrit ja peaaegu kõik läbivad riigi territooriumi. Venemaa vooluhulk on vaid 18 kilomeetrit.
Jõgi võtab vihma ajal vastu suurema osa veest. Suurvesi tekib suvel, kui Mongoolias on palju sademeid. Jõe suudmes asuvad Zheltura ja Tengereki (Burjaatia) külad. Jõe vett kasutatakse aktiivselt joogivee allikana.
Menza jõgi
Kohalikud elanikud nimetavad jõge Minzhiin-Gol. Geograafiliselt läbib kanal Mongooliat ja Venemaad, olles Chikoy jõe vasakpoolne lisajõgi. Menza saab alguse Baga-Khentai mäeharjal (Mongoolia). Mägedest laskudes läbib see Taga-Baikali territooriumi ja naaseb uuesti Mongooliast. Jõekanali kogupikkus on 337 kilomeetrit.
Jõgi on jääga kaetud novembri teisel poolel. Jäämurdmine algab aprilli lõpust. Külmutamise kogukestus on 145 kuni 180 päeva. Talvel külmub jõgi üle 130 sentimeetri. Jões elavad: lenok, taimen, ahven, mätas, harjus ja säga.
Orkhoni jõgi
Jõesäng läbib täielikult Mongoolia territooriumi ja on 1124 kilomeetri pikkune. Orkhon on Mongoolia suuruselt teine jõgi.
Jõe allikas asub Khangai mägedes. Jõe ülemjooks kulgeb mööda kitsast kanjonitaolist orgu. Orkhoni ülemjooks moodustab üsna kõrge (20 meetrit) ja laia (10 meetrit) kose. Jõe keskjooks läbib sügavat looklevat orgu ja alles mägedest väljudes laieneb jõgi 150 meetrini. Orkhon on novembrist aprillini jääga kaetud.
Jõeorus on palju huvitavaid kohti, mida külastada: Khara -Balgas - iidne linn, mis oli Uiguuri osariigi pealinn; Karakorum on Mongoli impeeriumi peamine linn. Lisaks leiti jõeorust mitu hunni matmishauda.
Egiin-Goli jõgi
Jõgi läbib Mongoolia territooriumi. Selle kogupikkus on 475 kilomeetrit. Jõe allikaks on Khubsuguli järve veed. Seejärel viib Egiin-Gol aeglaselt oma veed kaugele Selengasse. Umbes oktoobrist aprilli lõpuni on jõgi jääga kaetud ja muutub talviste kalapüügihuviliste jaoks atraktiivseks paigaks. Siit leitakse - harjus, lenok, taimen. Keskjooksul jaguneb jõgi paljudeks harudeks.