Enamasti kuuluvad Peruu jõed maailma suurima jõe - Amazonase - basseini.
Javari jõgi
Zhavari on üks Lõuna -Ameerika keskosas asuvatest jõgedest. Geograafiliselt kuulub jõesäng kahte riiki - Peruusse ja Brasiiliasse. Kanali kogupikkus on 1056 kilomeetrit. Javari läbib Brasiilia loodeosa ja on Amazonase parempoolne lisajõgi.
Jõe allikas on Peruu Andide (La Montagna) nõlvadel. Siis laskub see mägedest alla ja ülejäänud vooluks on Brasiilia ja Peruu vaheline looduslik piir.
Jõgi on suudmest 500 kilomeetrit laevatatav. Vihmaperioodil, mis kestab jaanuarist maini, suureneb laevatatava lõigu pikkus.
Girua jõgi
Girouis on üks paljudest Amazonase parempoolsetest lisajõgedest. Jõe kogupikkus on 3280 kilomeetrit. Allikas on La Montia (Peruu) linn, mis asub Peruu Andide jalamil.
Jõgi on laevatatav 1823 kilomeetri kaugusel selle ühinemiskohast (Cruzeiro do Suli valla territooriumile). Vesikond on asustatud, kuid peamiselt jõe keskjooksul.
Kurarai jõgi
Curarai on üks Lõuna -Ameerika jõgedest, mis asub kahe riigi - Ecuadori ja Peruu - territooriumil. See on Napo jõe parem lisajõgi. Jõe allikaks on Andide idapoolsed jalamid.
Kanali kogupikkus on 800 kilomeetrit. Ja see läbib Pastase (Ecuadori provints) ja Loreto (Peruu piirkond) territooriumi. Peruu territoorium on 414 kilomeetrit pikk. Kurarai on aastaringselt sügav, kuid laevatatav ainult alamjooksul. Jõesäng läbib hajaasustusega alasid. Jõe kaldal elavad peamiselt India rahvad - Waorani ja Quechua.
Madre de Diose jõgi
Madre de Dios läbib kahe riigi - Peruu ja Boliivia - territooriumi ning kuulub Amazonase vesikonda. Jõesängi kogupikkus on 640 kilomeetrit.
Jõe allikas on Peruu Andides.
Madre de Dios on üks tähtsamaid veeteid, mis asub Amazonase ülaosas. Jõe kaldal asub suur sadamalinn - Puerto Maldonado. Pärast teda on jõgi laevatatav.
Jõeorgu kasutatakse aktiivselt mangode kasvatamiseks. Lisaks kaevandatakse siin kulda, samuti raiutakse tööstuslikus mastaabis. Jõe kallastel on mitu looduskaitseala.
Mantaro jõgi
Jõesäng on täielikult Peruus ja selle pikkus on 724 kilomeetrit. Mantaro on Apurimaca jõe haru. Geograafiliselt läbib ta järgmiste provintside maid: Junin; Yauli; Hauka; Concepcion; Huancayo.
